零跑D99的座舱设计独具匠心，采用双层环绕布局，营造出宽敞而私密的驾乘空间。车内配备了引人瞩目的可开启MAX巨幕天窗，为乘客带来开阔视野。此外，3.9米长的“团圆”环形流光瀑布氛围灯与旗舰光语氛围灯交相辉映，配合航空阅读灯，共同打造出温馨浪漫的驾乘氛围。
座椅材质精选百万级全粒面半苯胺头层真皮，触感细腻，尽显奢华。第二排配备了两张124°零重力旋转航空座椅，支持3D环抱式加热、腿托及扶手加热、座椅通风以及10点式按摩功能，并巧妙设计了双侧桌板，满足商务休闲需求。灵活的旗舰三排座椅同样注重舒适性，支持坐垫与靠背双加热，能够电动翻转沉坑收纳，或电动90°折叠，甚至可以靠背180°放平独立成床。
前排区域亦不乏亮点，包括50W风冷无线快充功能，以及Nappa真皮四向电动方向盘，并提供10点SPA级按摩体验，确保驾驶者的舒适度。
该车还特别配置了34.3英寸的悬浮大桌板，方便同时放置多台笔记本电脑或平板设备。整车拥有43处储物空间，行李厢容积达到706L，拓展后可达2890L，储物能力出众。其他细节配置包括23扬声器杜比全景声音响系统，营造沉浸式听觉享受；车规级森野氧舱提供清新空气；电动开合冷暖冰箱随时提供饮品；迎宾脚部照明灯、606mm超长拉手以及电动开关门按键等，无一不彰显其科技与豪华兼备的旗舰定位。